Reka Mississippi je dom za številne vodne rastline in živali v zapletenem, medsebojno povezanem ekosistemu. Vodne rastline nudijo hrano in zatočišče številnim različnim vrstam v reki in so lahko majhne kot enocelične alge. Reka Mississippi vsebuje vrsto živali, od nevretenčarjev do rib, žab in drugih.
Alge tvorijo zelenkaste liste in lahko razbarvajo vodo.Alge
Po podatkih ministrstva za naravne vire Iowa se v Misisipiju gostijo dve glavni vrsti alg: zelena in modro-zelena. Zelene alge so osnovna biološka sestavina vsakega zdravega ekosistema; ustvarijo velike kolonije, ki lahko vodi dajo zelenkasto lito. Modro-zelene alge so manj zaželene in veljajo za nadležno algo. Povezani so s stresnimi ekosistemi in lahko povzročijo neprijetne okuse pri ribah ali pobijejo celotno populacijo.
Duckweed
Ta običajna prosto plavajoča rastlina ima en sam droben list in korenine, ki visijo v vodi, da sesajo hranila. Kot navaja že njegovo ime, je raka pomemben vir hrane za številne vodne ptice.
Lipovji
Beli lokvanji so običajno reko v Mississippiju in so sestavljeni iz velikih, plavajočih listov z usnjasto teksturo. Na listih proizvajajo velike bele cvetove, spodaj pa so ukoreninjeni v blatu.
Raki
Ti raki, imenovani tudi raki ali pajkice, spominjajo na majhne jastoge. Ti so predvsem hranilniki dna in porabijo iztoke drugih živali, korenja in majhnih živali. Domači in invazivni raki živijo v reki Mississippi.
Soma
Kanalski som je pogost prizor v reki Mississippi. So najštevilčnejša vrsta soma. Te ribe lahko zrastejo do presenetljivih velikosti in se držijo predvsem rečnega dna. Znane so po njihovi nagnjenosti k napadu na različne vrste vabe, vendar jih je treba jesti redko zaradi nevarnosti onesnaženja s PCB (poliklorirani bifenil).
Leopard žaba
Te pegaste žabe imenujemo tudi travniške žabe. Živijo v reki Mississippi in okoli nje. Zaradi svoje dovzetnosti za onesnaževala in onesnaževalce pogosto služijo kot kazalnik okolja. Večino časa preživijo ob robu potokov in drugih vodnih teles ter jedo večinoma žuželke, členonožce in druge nevretenčarje.
